Luego de diversas vicisitudes, cuando contaba con 49 años, Burmeister logró, con la ayuda del sabio Alexander von Humboldt, una licencia y los fondos necesarios, otorgados por el rey de Prusia para visitar los países del Plata. Estuvo en el Uruguay y después recorrió diversas provincias argentinas. Volvió a su país, donde recibió la noticia de que el gobierno del Estado de Buenos Aires, aún separado de la Confederación, lo había nombrado director del Museo Público. Su obra al frente de dicho instituto fue tan extraordinaria como notable fue su labor cuando, en 1870, el presidente Domingo F. Sarmiento lo nombró director de la Academia Nacional de Ciencias de Córdoba. El doctor Germán Burmeister fue durante mucho tiempo director del Museo de Buenos Aires, hasta un año antes de su muerte, ocurrida en 1893. Volúmenes publicados: REGINALDO DE LIZÁRRAGA, Descripción del Perú, Tucumán, Río de la Plata y Chile. Buenos Aires, 1999. JULIO RAMÓN DE CÉSAR, Noticias del Paraguay. Asunción, 2002. DAISY RÍPODAS ARDANAZ (Ed.), Viajeros al Río de la Plata. 1701-1725. Buenos Aires, 2002. JUAN FRANCISCO AGUIRRE, Discurso histórico sobre el Paraguay. Buenos Aires, 2003. FERNANDO ASSUNÇAO (Prólogo y notas), Viajeros al Río de la Plata. Tres viajeros a las costas orientales del Río de la Plata. (s. XVII, s XVIII, s. XIX). Montevideo, 2004. RAMÓN GIL NAVARRO, Memorias de una sociedad criolla. El Diario de Ramón Gil Navarro, 1845-1856. Buenos Aires, 2005. MIGUEL DE LEARTE, Fracasos de la fortuna y sucesos varios acaecidos. Buenos Aires, 2006. ALFRED M. DU GRATY, La Confederación Argentina. Buenos Aires, 2008. AGUSTÍN ÁNGEL OLMEDO, Guerra del Paraguay. Cuadernos de campaña (1867 - 1869), Buenos Aires, 2008.